全自动软水器采用美国富莱克（FLECK）全自动控制器来控制阀设备全自动运行，通过钠型阳离子树脂来进行交换反应。当原水通过多路阀进入到软水器中，原水中的钙镁离子（即硬度）便会与阳树脂中的钠离子发生反应，从而使水中的钙镁离子被钠离子所吸附，从而起到软化的作用。其化学反应式为[2RNa+Ca2+( Mg2+)=R2Ca(Mg)+2Na+]当钙镁型离子（即失效离子）达到一定程度后，出水硬度增大，便需通过氯化钠浓溶液来进行再生置换反应，使离子重新恢复至钠型。其化学反应式为[R2Ca+2Na+=2Rna+ Ca2+]在反应过程中，通过富莱克（FLECK）多路阀的控制，软水器会自动反冲洗（将树脂疏松，以利于盐浓溶液能更充分地与钠离子进行反应）、吸盐再生及慢清洗（使饱和盐溶液充分地与钠离子进行置换反应，同时进行慢清洗，以清洗掉水中的硬度），快冲洗及盐水重注、（用以冲掉水中的残余硬度及盐份，并且往盐箱内注水，以便为下次再生做准备）。

全自动软水器控制三种方式：
时 间 型：到设定时间开始还原，*短周期为一天，适用于空调系统等用水量稳定的系统供水。具有控制方式简单、成本低、操作简便的特点；

流 量 型：流量达到设定值时开始还原，适用于所有的系统供水。该方式精确度高，出水稳定可靠，设有记忆功能，停电后不需要重新进行数值设定；

微电脑型：系统由2-3台自动软水器进行组合，完全实现电脑程序控制，如配用中央控制器，可实现远程控制，计算机经过微处理器可以随时监控每台软水器的工作状态，显示和存储信息，随机设定工作和再生条件。适用于自动化程度较高的系统供水。